Figuren nedenfor viser Kapacitetsprojektets organisering. Kapacitetsplanen er vedtaget i alle kommuner og spildevandsselskaber. Aftaleparterne er de ti kommuner og deres spildevandsselskaber.

| Opbygning | Grupper |
|---|---|
| De 10 kommuner og deres 10 spildevandsselskaber | |
| Styregruppe: (med en repræsentant fra alle aftaleparter) Formand: Rebekka Nymark, HOFOR | Borgmestre og bestyrelsesformænd: (med en repræsentant fra alle aftalparter) |
| Projektsekretariatet: Projektleder: Christian Ammitsøe, HOFOR | |
| Projektgruppe: (med en repræsentant fra alle aftaleparter) Formand: Christian Ammitsøe, HOFOR | Delprojektgrupper: (med en repræsentant fra alle aftaleparter) Delprojektleder: Lokal Kommune/Forsyning |
| Ad hoc arbejdsopgaver Tovholder: Projektsekretariatet |
Borgmestrene og selskabernes bestyrelsesformænd har i opstartsfasen fulgt projektet tæt og været retningsgivende for projektet.
